Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULP0

NDRG4, Protein NDRG4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDRG4Q9ULP0 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NDRG4Q9ULP0 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
NDRG4Q9ULP0 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NDRG4Q9ULP0 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NDRG4Q9ULP0 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NDRG4Q9ULP0 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDRG4Q9ULP0 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NDRG4Q9ULP0 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDRG4Q9ULP0 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDRG4Q9ULP0 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDRG4Q9ULP0 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDRG4Q9ULP0 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDRG4Q9ULP0 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDRG4Q9ULP0 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDRG4Q9ULP0 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDRG4Q9ULP0 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDRG4Q9ULP0 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDRG4Q9ULP0 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NDRG4Q9ULP0 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NDRG4Q9ULP0 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDRG4Q9ULP0 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDRG4Q9ULP0 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDRG4Q9ULP0 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDRG4Q9ULP0 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDRG4Q9ULP0 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NDRG4Q9ULP0 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDRG4Q9ULP0 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDRG4Q9ULP0 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDRG4Q9ULP0 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDRG4Q9ULP0 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDRG4Q9ULP0 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDRG4Q9ULP0 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDRG4Q9ULP0 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDRG4Q9ULP0 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDRG4Q9ULP0 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDRG4Q9ULP0 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDRG4Q9ULP0 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDRG4Q9ULP0 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDRG4Q9ULP0 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDRG4Q9ULP0 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDRG4Q9ULP0 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDRG4Q9ULP0 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDRG4Q9ULP0 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDRG4Q9ULP0 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDRG4Q9ULP0 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDRG4Q9ULP0 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDRG4Q9ULP0 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDRG4Q9ULP0 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDRG4Q9ULP0 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDRG4Q9ULP0 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDRG4Q9ULP0 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDRG4Q9ULP0 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDRG4Q9ULP0 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NDRG4Q9ULP0 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDRG4Q9ULP0 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDRG4Q9ULP0 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDRG4Q9ULP0 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDRG4Q9ULP0 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDRG4Q9ULP0 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NDRG4Q9ULP0 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NDRG4Q9ULP0 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDRG4Q9ULP0 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDRG4Q9ULP0 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDRG4Q9ULP0 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDRG4Q9ULP0 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDRG4Q9ULP0 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDRG4Q9ULP0 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDRG4Q9ULP0 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDRG4Q9ULP0 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDRG4Q9ULP0 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDRG4Q9ULP0 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDRG4Q9ULP0 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDRG4Q9ULP0 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDRG4Q9ULP0 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDRG4Q9ULP0 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDRG4Q9ULP0 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDRG4Q9ULP0 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDRG4Q9ULP0 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDRG4Q9ULP0 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDRG4Q9ULP0 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDRG4Q9ULP0 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDRG4Q9ULP0 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDRG4Q9ULP0 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDRG4Q9ULP0 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDRG4Q9ULP0 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDRG4Q9ULP0 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDRG4Q9ULP0 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDRG4Q9ULP0 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDRG4Q9ULP0 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDRG4Q9ULP0 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDRG4Q9ULP0 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDRG4Q9ULP0 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDRG4Q9ULP0 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDRG4Q9ULP0 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NDRG4Q9ULP0 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDRG4Q9ULP0 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDRG4Q9ULP0 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDRG4Q9ULP0 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDRG4Q9ULP0 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDRG4Q9ULP0 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms