Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms