Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY5

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA1Q9UJY5 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
GGA1Q9UJY5 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms