Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD71

PPP1R1B, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R1BQ9UD71 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPP1R1BQ9UD71 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPP1R1BQ9UD71 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPP1R1BQ9UD71 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPP1R1BQ9UD71 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPP1R1BQ9UD71 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPP1R1BQ9UD71 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PPP1R1BQ9UD71 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPP1R1BQ9UD71 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPP1R1BQ9UD71 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPP1R1BQ9UD71 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPP1R1BQ9UD71 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPP1R1BQ9UD71 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPP1R1BQ9UD71 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPP1R1BQ9UD71 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPP1R1BQ9UD71 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPP1R1BQ9UD71 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPP1R1BQ9UD71 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPP1R1BQ9UD71 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PPP1R1BQ9UD71 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPP1R1BQ9UD71 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPP1R1BQ9UD71 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPP1R1BQ9UD71 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPP1R1BQ9UD71 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPP1R1BQ9UD71 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPP1R1BQ9UD71 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PPP1R1BQ9UD71 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPP1R1BQ9UD71 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPP1R1BQ9UD71 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PPP1R1BQ9UD71 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PPP1R1BQ9UD71 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPP1R1BQ9UD71 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPP1R1BQ9UD71 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPP1R1BQ9UD71 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPP1R1BQ9UD71 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPP1R1BQ9UD71 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPP1R1BQ9UD71 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPP1R1BQ9UD71 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPP1R1BQ9UD71 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPP1R1BQ9UD71 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPP1R1BQ9UD71 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPP1R1BQ9UD71 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PPP1R1BQ9UD71 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPP1R1BQ9UD71 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PPP1R1BQ9UD71 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPP1R1BQ9UD71 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPP1R1BQ9UD71 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPP1R1BQ9UD71 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPP1R1BQ9UD71 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PPP1R1BQ9UD71 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPP1R1BQ9UD71 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPP1R1BQ9UD71 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PPP1R1BQ9UD71 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPP1R1BQ9UD71 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPP1R1BQ9UD71 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPP1R1BQ9UD71 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPP1R1BQ9UD71 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPP1R1BQ9UD71 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPP1R1BQ9UD71 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPP1R1BQ9UD71 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPP1R1BQ9UD71 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPP1R1BQ9UD71 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPP1R1BQ9UD71 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPP1R1BQ9UD71 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPP1R1BQ9UD71 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPP1R1BQ9UD71 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPP1R1BQ9UD71 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPP1R1BQ9UD71 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPP1R1BQ9UD71 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPP1R1BQ9UD71 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPP1R1BQ9UD71 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPP1R1BQ9UD71 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPP1R1BQ9UD71 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPP1R1BQ9UD71 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPP1R1BQ9UD71 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPP1R1BQ9UD71 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPP1R1BQ9UD71 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PPP1R1BQ9UD71 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPP1R1BQ9UD71 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPP1R1BQ9UD71 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PPP1R1BQ9UD71 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PPP1R1BQ9UD71 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PPP1R1BQ9UD71 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPP1R1BQ9UD71 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPP1R1BQ9UD71 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPP1R1BQ9UD71 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPP1R1BQ9UD71 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPP1R1BQ9UD71 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPP1R1BQ9UD71 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPP1R1BQ9UD71 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPP1R1BQ9UD71 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPP1R1BQ9UD71 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPP1R1BQ9UD71 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPP1R1BQ9UD71 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPP1R1BQ9UD71 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPP1R1BQ9UD71 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPP1R1BQ9UD71 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPP1R1BQ9UD71 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPP1R1BQ9UD71 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPP1R1BQ9UD71 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms