Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX2

DUX4, Double homeobox protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4Q9UBX2 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms