Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms