Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1F3

ABRACL, Costars family protein ABRACL, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRACLQ9P1F3 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABRACLQ9P1F3 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABRACLQ9P1F3 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABRACLQ9P1F3 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABRACLQ9P1F3 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABRACLQ9P1F3 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABRACLQ9P1F3 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ABRACLQ9P1F3 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ABRACLQ9P1F3 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABRACLQ9P1F3 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABRACLQ9P1F3 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ABRACLQ9P1F3 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABRACLQ9P1F3 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABRACLQ9P1F3 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABRACLQ9P1F3 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABRACLQ9P1F3 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABRACLQ9P1F3 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABRACLQ9P1F3 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABRACLQ9P1F3 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABRACLQ9P1F3 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABRACLQ9P1F3 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABRACLQ9P1F3 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABRACLQ9P1F3 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABRACLQ9P1F3 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABRACLQ9P1F3 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABRACLQ9P1F3 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABRACLQ9P1F3 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABRACLQ9P1F3 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ABRACLQ9P1F3 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABRACLQ9P1F3 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABRACLQ9P1F3 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABRACLQ9P1F3 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABRACLQ9P1F3 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABRACLQ9P1F3 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABRACLQ9P1F3 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ABRACLQ9P1F3 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABRACLQ9P1F3 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ABRACLQ9P1F3 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ABRACLQ9P1F3 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABRACLQ9P1F3 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABRACLQ9P1F3 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABRACLQ9P1F3 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABRACLQ9P1F3 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABRACLQ9P1F3 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ABRACLQ9P1F3 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABRACLQ9P1F3 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABRACLQ9P1F3 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABRACLQ9P1F3 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABRACLQ9P1F3 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABRACLQ9P1F3 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABRACLQ9P1F3 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ABRACLQ9P1F3 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABRACLQ9P1F3 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABRACLQ9P1F3 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ABRACLQ9P1F3 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ABRACLQ9P1F3 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ABRACLQ9P1F3 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ABRACLQ9P1F3 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ABRACLQ9P1F3 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ABRACLQ9P1F3 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ABRACLQ9P1F3 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ABRACLQ9P1F3 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ABRACLQ9P1F3 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ABRACLQ9P1F3 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ABRACLQ9P1F3 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ABRACLQ9P1F3 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ABRACLQ9P1F3 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ABRACLQ9P1F3 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ABRACLQ9P1F3 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ABRACLQ9P1F3 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ABRACLQ9P1F3 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ABRACLQ9P1F3 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ABRACLQ9P1F3 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ABRACLQ9P1F3 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ABRACLQ9P1F3 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ABRACLQ9P1F3 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ABRACLQ9P1F3 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ABRACLQ9P1F3 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ABRACLQ9P1F3 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ABRACLQ9P1F3 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ABRACLQ9P1F3 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ABRACLQ9P1F3 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ABRACLQ9P1F3 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ABRACLQ9P1F3 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ABRACLQ9P1F3 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ABRACLQ9P1F3 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ABRACLQ9P1F3 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ABRACLQ9P1F3 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ABRACLQ9P1F3 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ABRACLQ9P1F3 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ABRACLQ9P1F3 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ABRACLQ9P1F3 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ABRACLQ9P1F3 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ABRACLQ9P1F3 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ABRACLQ9P1F3 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ABRACLQ9P1F3 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ABRACLQ9P1F3 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ABRACLQ9P1F3 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ABRACLQ9P1F3 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ABRACLQ9P1F3 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms