Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR2

LRP1B, Low-density lipoprotein receptor-related protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 4,599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1BQ9NZR2 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
LRP1BQ9NZR2 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LRP1BQ9NZR2 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LRP1BQ9NZR2 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LRP1BQ9NZR2 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LRP1BQ9NZR2 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LRP1BQ9NZR2 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
LRP1BQ9NZR2 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
LRP1BQ9NZR2 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LRP1BQ9NZR2 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LRP1BQ9NZR2 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LRP1BQ9NZR2 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LRP1BQ9NZR2 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LRP1BQ9NZR2 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LRP1BQ9NZR2 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LRP1BQ9NZR2 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
LRP1BQ9NZR2 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LRP1BQ9NZR2 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LRP1BQ9NZR2 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
LRP1BQ9NZR2 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LRP1BQ9NZR2 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LRP1BQ9NZR2 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LRP1BQ9NZR2 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LRP1BQ9NZR2 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LRP1BQ9NZR2 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LRP1BQ9NZR2 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LRP1BQ9NZR2 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LRP1BQ9NZR2 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LRP1BQ9NZR2 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LRP1BQ9NZR2 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LRP1BQ9NZR2 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
LRP1BQ9NZR2 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LRP1BQ9NZR2 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LRP1BQ9NZR2 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
LRP1BQ9NZR2 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LRP1BQ9NZR2 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LRP1BQ9NZR2 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LRP1BQ9NZR2 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LRP1BQ9NZR2 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LRP1BQ9NZR2 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LRP1BQ9NZR2 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LRP1BQ9NZR2 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LRP1BQ9NZR2 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LRP1BQ9NZR2 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LRP1BQ9NZR2 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LRP1BQ9NZR2 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LRP1BQ9NZR2 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LRP1BQ9NZR2 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LRP1BQ9NZR2 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LRP1BQ9NZR2 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LRP1BQ9NZR2 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LRP1BQ9NZR2 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LRP1BQ9NZR2 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LRP1BQ9NZR2 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LRP1BQ9NZR2 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LRP1BQ9NZR2 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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LRP1BQ9NZR2 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LRP1BQ9NZR2 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LRP1BQ9NZR2 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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LRP1BQ9NZR2 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LRP1BQ9NZR2 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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LRP1BQ9NZR2 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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LRP1BQ9NZR2 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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LRP1BQ9NZR2 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LRP1BQ9NZR2 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LRP1BQ9NZR2 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LRP1BQ9NZR2 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LRP1BQ9NZR2 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LRP1BQ9NZR2 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LRP1BQ9NZR2 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LRP1BQ9NZR2 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LRP1BQ9NZR2 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LRP1BQ9NZR2 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
LRP1BQ9NZR2 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LRP1BQ9NZR2 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LRP1BQ9NZR2 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LRP1BQ9NZR2 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
LRP1BQ9NZR2 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LRP1BQ9NZR2 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LRP1BQ9NZR2 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LRP1BQ9NZR2 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LRP1BQ9NZR2 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LRP1BQ9NZR2 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LRP1BQ9NZR2 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LRP1BQ9NZR2 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LRP1BQ9NZR2 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LRP1BQ9NZR2 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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