Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWB7

IFT57, Intraflagellar transport protein 57 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT57Q9NWB7 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFT57Q9NWB7 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms