Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms