Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms