Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms