Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD43

PTPRH, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, humanhuman

Predictions only

Length 1,115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRHQ9HD43 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRHQ9HD43 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRHQ9HD43 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRHQ9HD43 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRHQ9HD43 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRHQ9HD43 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRHQ9HD43 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRHQ9HD43 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRHQ9HD43 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRHQ9HD43 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRHQ9HD43 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRHQ9HD43 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRHQ9HD43 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRHQ9HD43 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRHQ9HD43 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRHQ9HD43 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRHQ9HD43 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRHQ9HD43 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRHQ9HD43 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRHQ9HD43 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRHQ9HD43 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRHQ9HD43 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRHQ9HD43 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRHQ9HD43 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRHQ9HD43 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRHQ9HD43 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRHQ9HD43 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRHQ9HD43 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRHQ9HD43 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRHQ9HD43 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRHQ9HD43 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRHQ9HD43 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRHQ9HD43 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRHQ9HD43 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRHQ9HD43 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRHQ9HD43 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRHQ9HD43 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRHQ9HD43 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRHQ9HD43 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRHQ9HD43 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRHQ9HD43 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRHQ9HD43 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRHQ9HD43 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRHQ9HD43 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRHQ9HD43 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRHQ9HD43 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRHQ9HD43 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRHQ9HD43 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRHQ9HD43 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRHQ9HD43 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRHQ9HD43 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRHQ9HD43 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRHQ9HD43 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRHQ9HD43 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRHQ9HD43 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRHQ9HD43 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRHQ9HD43 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRHQ9HD43 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRHQ9HD43 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRHQ9HD43 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRHQ9HD43 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRHQ9HD43 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRHQ9HD43 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRHQ9HD43 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRHQ9HD43 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRHQ9HD43 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRHQ9HD43 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRHQ9HD43 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRHQ9HD43 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRHQ9HD43 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRHQ9HD43 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRHQ9HD43 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRHQ9HD43 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRHQ9HD43 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRHQ9HD43 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRHQ9HD43 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRHQ9HD43 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRHQ9HD43 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRHQ9HD43 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRHQ9HD43 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRHQ9HD43 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PTPRHQ9HD43 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PTPRHQ9HD43 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PTPRHQ9HD43 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PTPRHQ9HD43 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PTPRHQ9HD43 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PTPRHQ9HD43 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRHQ9HD43 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRHQ9HD43 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRHQ9HD43 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRHQ9HD43 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRHQ9HD43 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRHQ9HD43 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRHQ9HD43 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRHQ9HD43 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRHQ9HD43 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRHQ9HD43 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRHQ9HD43 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRHQ9HD43 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRHQ9HD43 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
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