Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC97

GPR35, G-protein coupled receptor 35, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR35Q9HC97 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPR35Q9HC97 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPR35Q9HC97 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPR35Q9HC97 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPR35Q9HC97 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPR35Q9HC97 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPR35Q9HC97 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPR35Q9HC97 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPR35Q9HC97 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPR35Q9HC97 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPR35Q9HC97 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPR35Q9HC97 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPR35Q9HC97 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPR35Q9HC97 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPR35Q9HC97 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPR35Q9HC97 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPR35Q9HC97 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPR35Q9HC97 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms