Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB31

SEBOX, Homeobox protein SEBOX, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEBOXQ9HB31 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEBOXQ9HB31 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEBOXQ9HB31 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEBOXQ9HB31 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEBOXQ9HB31 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEBOXQ9HB31 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEBOXQ9HB31 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEBOXQ9HB31 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEBOXQ9HB31 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEBOXQ9HB31 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEBOXQ9HB31 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEBOXQ9HB31 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEBOXQ9HB31 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEBOXQ9HB31 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEBOXQ9HB31 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEBOXQ9HB31 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SEBOXQ9HB31 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEBOXQ9HB31 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEBOXQ9HB31 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEBOXQ9HB31 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEBOXQ9HB31 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEBOXQ9HB31 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEBOXQ9HB31 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEBOXQ9HB31 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEBOXQ9HB31 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SEBOXQ9HB31 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEBOXQ9HB31 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEBOXQ9HB31 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEBOXQ9HB31 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEBOXQ9HB31 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEBOXQ9HB31 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEBOXQ9HB31 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEBOXQ9HB31 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEBOXQ9HB31 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEBOXQ9HB31 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEBOXQ9HB31 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEBOXQ9HB31 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEBOXQ9HB31 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEBOXQ9HB31 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEBOXQ9HB31 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEBOXQ9HB31 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEBOXQ9HB31 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEBOXQ9HB31 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SEBOXQ9HB31 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEBOXQ9HB31 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEBOXQ9HB31 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEBOXQ9HB31 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEBOXQ9HB31 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEBOXQ9HB31 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEBOXQ9HB31 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEBOXQ9HB31 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms