Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLMPQ9H6B4 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms