Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0E8

LNPK, Protein lunapark, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNPKQ9C0E8 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LNPKQ9C0E8 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms