Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms