Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY77

POLDIP3, Polymerase delta-interacting protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLDIP3Q9BY77 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLDIP3Q9BY77 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLDIP3Q9BY77 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLDIP3Q9BY77 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLDIP3Q9BY77 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLDIP3Q9BY77 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
POLDIP3Q9BY77 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
POLDIP3Q9BY77 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLDIP3Q9BY77 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLDIP3Q9BY77 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLDIP3Q9BY77 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLDIP3Q9BY77 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
POLDIP3Q9BY77 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLDIP3Q9BY77 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLDIP3Q9BY77 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLDIP3Q9BY77 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLDIP3Q9BY77 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLDIP3Q9BY77 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLDIP3Q9BY77 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLDIP3Q9BY77 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLDIP3Q9BY77 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLDIP3Q9BY77 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLDIP3Q9BY77 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLDIP3Q9BY77 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLDIP3Q9BY77 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLDIP3Q9BY77 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
POLDIP3Q9BY77 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLDIP3Q9BY77 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLDIP3Q9BY77 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLDIP3Q9BY77 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLDIP3Q9BY77 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLDIP3Q9BY77 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLDIP3Q9BY77 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLDIP3Q9BY77 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
POLDIP3Q9BY77 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLDIP3Q9BY77 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLDIP3Q9BY77 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLDIP3Q9BY77 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLDIP3Q9BY77 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLDIP3Q9BY77 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLDIP3Q9BY77 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLDIP3Q9BY77 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLDIP3Q9BY77 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLDIP3Q9BY77 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLDIP3Q9BY77 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
POLDIP3Q9BY77 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLDIP3Q9BY77 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLDIP3Q9BY77 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLDIP3Q9BY77 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLDIP3Q9BY77 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLDIP3Q9BY77 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLDIP3Q9BY77 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLDIP3Q9BY77 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLDIP3Q9BY77 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLDIP3Q9BY77 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLDIP3Q9BY77 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLDIP3Q9BY77 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLDIP3Q9BY77 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLDIP3Q9BY77 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLDIP3Q9BY77 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLDIP3Q9BY77 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLDIP3Q9BY77 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLDIP3Q9BY77 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLDIP3Q9BY77 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLDIP3Q9BY77 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLDIP3Q9BY77 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLDIP3Q9BY77 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLDIP3Q9BY77 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLDIP3Q9BY77 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
POLDIP3Q9BY77 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLDIP3Q9BY77 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLDIP3Q9BY77 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLDIP3Q9BY77 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLDIP3Q9BY77 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLDIP3Q9BY77 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLDIP3Q9BY77 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLDIP3Q9BY77 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLDIP3Q9BY77 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLDIP3Q9BY77 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLDIP3Q9BY77 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLDIP3Q9BY77 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLDIP3Q9BY77 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLDIP3Q9BY77 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLDIP3Q9BY77 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLDIP3Q9BY77 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
POLDIP3Q9BY77 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLDIP3Q9BY77 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLDIP3Q9BY77 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLDIP3Q9BY77 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLDIP3Q9BY77 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLDIP3Q9BY77 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
POLDIP3Q9BY77 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLDIP3Q9BY77 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLDIP3Q9BY77 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLDIP3Q9BY77 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLDIP3Q9BY77 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLDIP3Q9BY77 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLDIP3Q9BY77 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLDIP3Q9BY77 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLDIP3Q9BY77 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms