Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC4A5Q9BY07 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC4A5Q9BY07 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC4A5Q9BY07 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC4A5Q9BY07 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC4A5Q9BY07 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC4A5Q9BY07 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC4A5Q9BY07 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC4A5Q9BY07 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC4A5Q9BY07 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC4A5Q9BY07 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC4A5Q9BY07 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC4A5Q9BY07 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC4A5Q9BY07 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC4A5Q9BY07 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC4A5Q9BY07 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC4A5Q9BY07 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC4A5Q9BY07 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC4A5Q9BY07 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC4A5Q9BY07 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC4A5Q9BY07 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC4A5Q9BY07 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC4A5Q9BY07 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC4A5Q9BY07 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC4A5Q9BY07 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC4A5Q9BY07 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC4A5Q9BY07 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC4A5Q9BY07 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC4A5Q9BY07 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC4A5Q9BY07 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC4A5Q9BY07 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC4A5Q9BY07 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC4A5Q9BY07 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC4A5Q9BY07 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC4A5Q9BY07 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC4A5Q9BY07 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC4A5Q9BY07 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC4A5Q9BY07 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC4A5Q9BY07 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC4A5Q9BY07 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC4A5Q9BY07 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC4A5Q9BY07 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC4A5Q9BY07 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC4A5Q9BY07 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC4A5Q9BY07 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC4A5Q9BY07 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC4A5Q9BY07 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC4A5Q9BY07 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC4A5Q9BY07 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC4A5Q9BY07 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC4A5Q9BY07 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC4A5Q9BY07 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC4A5Q9BY07 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC4A5Q9BY07 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC4A5Q9BY07 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC4A5Q9BY07 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC4A5Q9BY07 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC4A5Q9BY07 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC4A5Q9BY07 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC4A5Q9BY07 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC4A5Q9BY07 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC4A5Q9BY07 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC4A5Q9BY07 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC4A5Q9BY07 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC4A5Q9BY07 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC4A5Q9BY07 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC4A5Q9BY07 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC4A5Q9BY07 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC4A5Q9BY07 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC4A5Q9BY07 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC4A5Q9BY07 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC4A5Q9BY07 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC4A5Q9BY07 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC4A5Q9BY07 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC4A5Q9BY07 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC4A5Q9BY07 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC4A5Q9BY07 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC4A5Q9BY07 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC4A5Q9BY07 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC4A5Q9BY07 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC4A5Q9BY07 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC4A5Q9BY07 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC4A5Q9BY07 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC4A5Q9BY07 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC4A5Q9BY07 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC4A5Q9BY07 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC4A5Q9BY07 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC4A5Q9BY07 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC4A5Q9BY07 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC4A5Q9BY07 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC4A5Q9BY07 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC4A5Q9BY07 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC4A5Q9BY07 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC4A5Q9BY07 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC4A5Q9BY07 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC4A5Q9BY07 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC4A5Q9BY07 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC4A5Q9BY07 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC4A5Q9BY07 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC4A5Q9BY07 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms