Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms