Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWX5

GATA5, Transcription factor GATA-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA5Q9BWX5 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
GATA5Q9BWX5 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GATA5Q9BWX5 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms