Protein–RNA interactions for Protein: Q96SD1

DCLRE1C, Protein artemis, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 692 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1CQ96SD1 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DCLRE1CQ96SD1 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms