Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms