Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms