Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAPPC9Q96Q05 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC9Q96Q05 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms