Protein–RNA interactions for Protein: Q96MX0

CMTM3, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3Q96MX0 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CMTM3Q96MX0 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.5 ms