Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
JSRP1Q96MG2 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms