Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC7Q96M83 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms