Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms