Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BORCS6Q96GS4 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms