Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAF2Q96CS3 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms