Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms