Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC112Q8NEF3 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms