Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATG16L2Q8NAA4 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATG16L2Q8NAA4 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATG16L2Q8NAA4 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATG16L2Q8NAA4 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATG16L2Q8NAA4 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATG16L2Q8NAA4 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATG16L2Q8NAA4 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATG16L2Q8NAA4 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ATG16L2Q8NAA4 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATG16L2Q8NAA4 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ATG16L2Q8NAA4 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ATG16L2Q8NAA4 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATG16L2Q8NAA4 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATG16L2Q8NAA4 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATG16L2Q8NAA4 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATG16L2Q8NAA4 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATG16L2Q8NAA4 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATG16L2Q8NAA4 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATG16L2Q8NAA4 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG16L2Q8NAA4 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG16L2Q8NAA4 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG16L2Q8NAA4 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG16L2Q8NAA4 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG16L2Q8NAA4 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG16L2Q8NAA4 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG16L2Q8NAA4 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG16L2Q8NAA4 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG16L2Q8NAA4 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG16L2Q8NAA4 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG16L2Q8NAA4 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG16L2Q8NAA4 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG16L2Q8NAA4 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG16L2Q8NAA4 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG16L2Q8NAA4 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG16L2Q8NAA4 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG16L2Q8NAA4 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG16L2Q8NAA4 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG16L2Q8NAA4 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG16L2Q8NAA4 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG16L2Q8NAA4 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG16L2Q8NAA4 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG16L2Q8NAA4 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG16L2Q8NAA4 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG16L2Q8NAA4 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG16L2Q8NAA4 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG16L2Q8NAA4 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG16L2Q8NAA4 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG16L2Q8NAA4 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG16L2Q8NAA4 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG16L2Q8NAA4 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG16L2Q8NAA4 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG16L2Q8NAA4 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG16L2Q8NAA4 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG16L2Q8NAA4 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG16L2Q8NAA4 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG16L2Q8NAA4 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG16L2Q8NAA4 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG16L2Q8NAA4 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG16L2Q8NAA4 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG16L2Q8NAA4 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG16L2Q8NAA4 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG16L2Q8NAA4 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATG16L2Q8NAA4 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG16L2Q8NAA4 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG16L2Q8NAA4 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG16L2Q8NAA4 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG16L2Q8NAA4 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG16L2Q8NAA4 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG16L2Q8NAA4 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG16L2Q8NAA4 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG16L2Q8NAA4 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG16L2Q8NAA4 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG16L2Q8NAA4 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG16L2Q8NAA4 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG16L2Q8NAA4 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG16L2Q8NAA4 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG16L2Q8NAA4 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG16L2Q8NAA4 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG16L2Q8NAA4 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG16L2Q8NAA4 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG16L2Q8NAA4 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG16L2Q8NAA4 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG16L2Q8NAA4 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG16L2Q8NAA4 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG16L2Q8NAA4 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG16L2Q8NAA4 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG16L2Q8NAA4 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG16L2Q8NAA4 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG16L2Q8NAA4 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG16L2Q8NAA4 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG16L2Q8NAA4 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG16L2Q8NAA4 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG16L2Q8NAA4 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG16L2Q8NAA4 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG16L2Q8NAA4 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG16L2Q8NAA4 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG16L2Q8NAA4 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG16L2Q8NAA4 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG16L2Q8NAA4 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms