Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD53Q8N9V6 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD53Q8N9V6 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms