Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXI1

RHOT2, Mitochondrial Rho GTPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOT2Q8IXI1 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOT2Q8IXI1 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOT2Q8IXI1 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOT2Q8IXI1 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOT2Q8IXI1 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOT2Q8IXI1 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOT2Q8IXI1 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOT2Q8IXI1 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOT2Q8IXI1 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOT2Q8IXI1 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOT2Q8IXI1 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOT2Q8IXI1 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOT2Q8IXI1 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOT2Q8IXI1 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOT2Q8IXI1 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOT2Q8IXI1 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOT2Q8IXI1 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOT2Q8IXI1 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOT2Q8IXI1 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOT2Q8IXI1 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOT2Q8IXI1 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOT2Q8IXI1 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOT2Q8IXI1 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOT2Q8IXI1 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOT2Q8IXI1 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOT2Q8IXI1 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOT2Q8IXI1 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOT2Q8IXI1 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOT2Q8IXI1 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOT2Q8IXI1 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOT2Q8IXI1 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOT2Q8IXI1 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOT2Q8IXI1 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOT2Q8IXI1 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOT2Q8IXI1 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOT2Q8IXI1 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOT2Q8IXI1 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOT2Q8IXI1 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOT2Q8IXI1 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOT2Q8IXI1 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOT2Q8IXI1 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOT2Q8IXI1 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOT2Q8IXI1 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOT2Q8IXI1 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOT2Q8IXI1 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOT2Q8IXI1 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOT2Q8IXI1 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOT2Q8IXI1 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOT2Q8IXI1 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOT2Q8IXI1 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOT2Q8IXI1 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOT2Q8IXI1 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOT2Q8IXI1 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOT2Q8IXI1 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOT2Q8IXI1 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOT2Q8IXI1 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOT2Q8IXI1 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOT2Q8IXI1 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOT2Q8IXI1 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHOT2Q8IXI1 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHOT2Q8IXI1 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHOT2Q8IXI1 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHOT2Q8IXI1 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHOT2Q8IXI1 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHOT2Q8IXI1 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHOT2Q8IXI1 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHOT2Q8IXI1 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHOT2Q8IXI1 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHOT2Q8IXI1 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHOT2Q8IXI1 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHOT2Q8IXI1 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHOT2Q8IXI1 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHOT2Q8IXI1 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHOT2Q8IXI1 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHOT2Q8IXI1 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHOT2Q8IXI1 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHOT2Q8IXI1 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHOT2Q8IXI1 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHOT2Q8IXI1 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHOT2Q8IXI1 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHOT2Q8IXI1 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHOT2Q8IXI1 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHOT2Q8IXI1 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHOT2Q8IXI1 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHOT2Q8IXI1 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHOT2Q8IXI1 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RHOT2Q8IXI1 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHOT2Q8IXI1 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHOT2Q8IXI1 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RHOT2Q8IXI1 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHOT2Q8IXI1 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHOT2Q8IXI1 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHOT2Q8IXI1 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RHOT2Q8IXI1 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHOT2Q8IXI1 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHOT2Q8IXI1 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHOT2Q8IXI1 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHOT2Q8IXI1 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHOT2Q8IXI1 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHOT2Q8IXI1 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms