Protein–RNA interactions for Protein: Q86XW9

NME9, Thioredoxin domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME9Q86XW9 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NME9Q86XW9 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms