Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
CCDC84Q86UT8 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC84Q86UT8 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms