Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.02
TRAPPC6BQ86SZ2 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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