Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHLHA9Q7RTU4 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms