Protein–RNA interactions for Protein: Q709F0

ACAD11, Acyl-CoA dehydrogenase family member 11, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAD11Q709F0 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACAD11Q709F0 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACAD11Q709F0 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACAD11Q709F0 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACAD11Q709F0 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ACAD11Q709F0 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACAD11Q709F0 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACAD11Q709F0 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACAD11Q709F0 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACAD11Q709F0 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACAD11Q709F0 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACAD11Q709F0 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACAD11Q709F0 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACAD11Q709F0 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACAD11Q709F0 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACAD11Q709F0 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACAD11Q709F0 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACAD11Q709F0 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACAD11Q709F0 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACAD11Q709F0 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACAD11Q709F0 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACAD11Q709F0 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACAD11Q709F0 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACAD11Q709F0 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACAD11Q709F0 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACAD11Q709F0 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACAD11Q709F0 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACAD11Q709F0 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACAD11Q709F0 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACAD11Q709F0 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACAD11Q709F0 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACAD11Q709F0 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACAD11Q709F0 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACAD11Q709F0 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACAD11Q709F0 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ACAD11Q709F0 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ACAD11Q709F0 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACAD11Q709F0 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACAD11Q709F0 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACAD11Q709F0 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACAD11Q709F0 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACAD11Q709F0 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACAD11Q709F0 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ACAD11Q709F0 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ACAD11Q709F0 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACAD11Q709F0 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACAD11Q709F0 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ACAD11Q709F0 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ACAD11Q709F0 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACAD11Q709F0 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACAD11Q709F0 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACAD11Q709F0 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACAD11Q709F0 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACAD11Q709F0 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACAD11Q709F0 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACAD11Q709F0 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACAD11Q709F0 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACAD11Q709F0 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACAD11Q709F0 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACAD11Q709F0 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACAD11Q709F0 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACAD11Q709F0 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACAD11Q709F0 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACAD11Q709F0 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACAD11Q709F0 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACAD11Q709F0 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACAD11Q709F0 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACAD11Q709F0 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACAD11Q709F0 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACAD11Q709F0 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACAD11Q709F0 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACAD11Q709F0 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACAD11Q709F0 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACAD11Q709F0 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACAD11Q709F0 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACAD11Q709F0 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACAD11Q709F0 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACAD11Q709F0 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACAD11Q709F0 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACAD11Q709F0 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACAD11Q709F0 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ACAD11Q709F0 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACAD11Q709F0 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACAD11Q709F0 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACAD11Q709F0 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ACAD11Q709F0 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACAD11Q709F0 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACAD11Q709F0 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACAD11Q709F0 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACAD11Q709F0 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACAD11Q709F0 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACAD11Q709F0 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACAD11Q709F0 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACAD11Q709F0 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACAD11Q709F0 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACAD11Q709F0 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACAD11Q709F0 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACAD11Q709F0 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ACAD11Q709F0 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACAD11Q709F0 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms