Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUT3

FRMD7, FERM domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD7Q6ZUT3 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FRMD7Q6ZUT3 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FRMD7Q6ZUT3 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FRMD7Q6ZUT3 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FRMD7Q6ZUT3 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FRMD7Q6ZUT3 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FRMD7Q6ZUT3 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FRMD7Q6ZUT3 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FRMD7Q6ZUT3 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FRMD7Q6ZUT3 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FRMD7Q6ZUT3 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FRMD7Q6ZUT3 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FRMD7Q6ZUT3 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FRMD7Q6ZUT3 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FRMD7Q6ZUT3 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FRMD7Q6ZUT3 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FRMD7Q6ZUT3 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FRMD7Q6ZUT3 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FRMD7Q6ZUT3 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FRMD7Q6ZUT3 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FRMD7Q6ZUT3 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FRMD7Q6ZUT3 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FRMD7Q6ZUT3 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FRMD7Q6ZUT3 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FRMD7Q6ZUT3 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FRMD7Q6ZUT3 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FRMD7Q6ZUT3 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FRMD7Q6ZUT3 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FRMD7Q6ZUT3 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FRMD7Q6ZUT3 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FRMD7Q6ZUT3 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FRMD7Q6ZUT3 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FRMD7Q6ZUT3 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FRMD7Q6ZUT3 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FRMD7Q6ZUT3 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FRMD7Q6ZUT3 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FRMD7Q6ZUT3 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FRMD7Q6ZUT3 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FRMD7Q6ZUT3 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FRMD7Q6ZUT3 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FRMD7Q6ZUT3 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FRMD7Q6ZUT3 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FRMD7Q6ZUT3 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FRMD7Q6ZUT3 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FRMD7Q6ZUT3 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FRMD7Q6ZUT3 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FRMD7Q6ZUT3 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FRMD7Q6ZUT3 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FRMD7Q6ZUT3 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FRMD7Q6ZUT3 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FRMD7Q6ZUT3 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FRMD7Q6ZUT3 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FRMD7Q6ZUT3 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FRMD7Q6ZUT3 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FRMD7Q6ZUT3 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FRMD7Q6ZUT3 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FRMD7Q6ZUT3 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FRMD7Q6ZUT3 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FRMD7Q6ZUT3 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FRMD7Q6ZUT3 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FRMD7Q6ZUT3 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FRMD7Q6ZUT3 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FRMD7Q6ZUT3 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FRMD7Q6ZUT3 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FRMD7Q6ZUT3 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FRMD7Q6ZUT3 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FRMD7Q6ZUT3 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FRMD7Q6ZUT3 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FRMD7Q6ZUT3 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FRMD7Q6ZUT3 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FRMD7Q6ZUT3 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FRMD7Q6ZUT3 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FRMD7Q6ZUT3 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FRMD7Q6ZUT3 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FRMD7Q6ZUT3 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FRMD7Q6ZUT3 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FRMD7Q6ZUT3 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FRMD7Q6ZUT3 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FRMD7Q6ZUT3 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FRMD7Q6ZUT3 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FRMD7Q6ZUT3 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FRMD7Q6ZUT3 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FRMD7Q6ZUT3 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FRMD7Q6ZUT3 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FRMD7Q6ZUT3 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FRMD7Q6ZUT3 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FRMD7Q6ZUT3 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FRMD7Q6ZUT3 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FRMD7Q6ZUT3 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FRMD7Q6ZUT3 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FRMD7Q6ZUT3 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FRMD7Q6ZUT3 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FRMD7Q6ZUT3 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FRMD7Q6ZUT3 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FRMD7Q6ZUT3 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FRMD7Q6ZUT3 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FRMD7Q6ZUT3 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FRMD7Q6ZUT3 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FRMD7Q6ZUT3 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FRMD7Q6ZUT3 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms