Protein–RNA interactions for Protein: Q6VVB1

NHLRC1, E3 ubiquitin-protein ligase NHLRC1, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC1Q6VVB1 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLRC1Q6VVB1 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLRC1Q6VVB1 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLRC1Q6VVB1 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLRC1Q6VVB1 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLRC1Q6VVB1 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLRC1Q6VVB1 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLRC1Q6VVB1 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLRC1Q6VVB1 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLRC1Q6VVB1 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLRC1Q6VVB1 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLRC1Q6VVB1 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLRC1Q6VVB1 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLRC1Q6VVB1 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLRC1Q6VVB1 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLRC1Q6VVB1 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLRC1Q6VVB1 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLRC1Q6VVB1 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLRC1Q6VVB1 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLRC1Q6VVB1 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLRC1Q6VVB1 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLRC1Q6VVB1 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLRC1Q6VVB1 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLRC1Q6VVB1 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLRC1Q6VVB1 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLRC1Q6VVB1 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLRC1Q6VVB1 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLRC1Q6VVB1 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLRC1Q6VVB1 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLRC1Q6VVB1 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLRC1Q6VVB1 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLRC1Q6VVB1 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLRC1Q6VVB1 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLRC1Q6VVB1 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLRC1Q6VVB1 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLRC1Q6VVB1 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLRC1Q6VVB1 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLRC1Q6VVB1 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLRC1Q6VVB1 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLRC1Q6VVB1 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLRC1Q6VVB1 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLRC1Q6VVB1 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLRC1Q6VVB1 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLRC1Q6VVB1 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLRC1Q6VVB1 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLRC1Q6VVB1 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLRC1Q6VVB1 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLRC1Q6VVB1 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLRC1Q6VVB1 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLRC1Q6VVB1 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLRC1Q6VVB1 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLRC1Q6VVB1 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NHLRC1Q6VVB1 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NHLRC1Q6VVB1 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NHLRC1Q6VVB1 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NHLRC1Q6VVB1 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NHLRC1Q6VVB1 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NHLRC1Q6VVB1 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NHLRC1Q6VVB1 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NHLRC1Q6VVB1 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NHLRC1Q6VVB1 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NHLRC1Q6VVB1 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NHLRC1Q6VVB1 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NHLRC1Q6VVB1 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NHLRC1Q6VVB1 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NHLRC1Q6VVB1 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NHLRC1Q6VVB1 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NHLRC1Q6VVB1 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NHLRC1Q6VVB1 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NHLRC1Q6VVB1 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NHLRC1Q6VVB1 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NHLRC1Q6VVB1 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NHLRC1Q6VVB1 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NHLRC1Q6VVB1 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NHLRC1Q6VVB1 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NHLRC1Q6VVB1 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NHLRC1Q6VVB1 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NHLRC1Q6VVB1 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NHLRC1Q6VVB1 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NHLRC1Q6VVB1 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NHLRC1Q6VVB1 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NHLRC1Q6VVB1 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NHLRC1Q6VVB1 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NHLRC1Q6VVB1 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NHLRC1Q6VVB1 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NHLRC1Q6VVB1 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NHLRC1Q6VVB1 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NHLRC1Q6VVB1 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NHLRC1Q6VVB1 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NHLRC1Q6VVB1 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NHLRC1Q6VVB1 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NHLRC1Q6VVB1 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NHLRC1Q6VVB1 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NHLRC1Q6VVB1 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NHLRC1Q6VVB1 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NHLRC1Q6VVB1 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NHLRC1Q6VVB1 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NHLRC1Q6VVB1 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NHLRC1Q6VVB1 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NHLRC1Q6VVB1 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms