Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMARCD3Q6STE5 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77 ms