Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.5 ms