Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
LETMD1Q6P1Q0 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LETMD1Q6P1Q0 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms