Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT16

SLC18B1, MFS-type transporter SLC18B1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18B1Q6NT16 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC18B1Q6NT16 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC18B1Q6NT16 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC18B1Q6NT16 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC18B1Q6NT16 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC18B1Q6NT16 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC18B1Q6NT16 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC18B1Q6NT16 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC18B1Q6NT16 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC18B1Q6NT16 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC18B1Q6NT16 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC18B1Q6NT16 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC18B1Q6NT16 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC18B1Q6NT16 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC18B1Q6NT16 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC18B1Q6NT16 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC18B1Q6NT16 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC18B1Q6NT16 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC18B1Q6NT16 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC18B1Q6NT16 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC18B1Q6NT16 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC18B1Q6NT16 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC18B1Q6NT16 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC18B1Q6NT16 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC18B1Q6NT16 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC18B1Q6NT16 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC18B1Q6NT16 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms