Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
NANOGP8Q6NSW7 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms