Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms